中医临床基础学科由我国老一辈中医药学家陈慎吾、刘渡舟在国内率先确立。1981年，本学科被分别批准为硕士和博士学位授权点，成为本专业最早的中医学硕、博士授权点。2002年本学科被评为国家中医药管理局重点支持学科、北京市重点学科。1996年以来，本学科又先后成为国家“211工程”建设单位、国家理科基础人才培养基地与国家生命科学与技术人才培养基地的重要支撑学科。2007年本学科被评为国家重点学科。自1991年中华中医药学会仲景学说专业委员会成立以来，本学科一直为该学会的主委单位，多次主持召开国际国内的张仲景学术交流会议。学科科所设课程《伤寒论》是中医“四大经典”课程的主体，参与编写了中医院校第一部《伤寒论》教材。2002年，《伤寒论》课程被评为教育部“国家理科基地名牌课程”。2004年公开发行全国第一套《伤寒论》教学录象光盘。近5年来，学科主编和参与编写各类教材11 部，2006年，作为主编单位主持编写了全国高等院校“十一五”规划教材《伤寒论讲义》。